1. Кто нибудь нашел 100% решение этого глюка?
2. Есть ли смысл установить снаббер в цепь управления катушкой контактора? Может катушка контактора наводит помеху влияющую на работу прибора? Управление контактором через DO1.
3. К DO2 непосредственно подключена дизельная горелка с электродвигателем наддува мощностью 200 Вт 220В. Может индуктивная нагрузка подключенная непосредственно к выходу ПР негативно влиять на его работу
Если есть возможность уменьшить токи через контакты ПР - уменьшайте. Дребезг контактов при больших токах может вызывать радиоизлучение - помехи. А 220V 0.2 kW это, примерно, 1 А тока.
В моей практике за полгода-год от дребезга сгорали обмотки реле, включённого параллельно клапану подачи дизтоплива на горелку 1-й ступени - нагрузкой реле был вход ПЛК. Клапаном управлял автомат горения Siemens LME22 или LMO22, сигнал от реле использовался как сигнал подтверждения работы от горелки.

Не знаю, насколько это сейчас ещё актуально, но лет 10 назад были сообщения о перезагрузке ПР при включении рации на передачу рядом с корпусом ПР.

Боюсь, что Вам предстоит устранение методом последовательного перебора вероятных причин.