Посмотрите, может он криво загрузился, или еще что-то, все должно открываться.
По поводу АНР, пока не очень понятно что за система у Вас, но возможно проще АНР выполнить в отдельном файле, получить коэффициенты и занести их в отдельный проект, где будут только ПИД регулирование, это должно быть проще в обслуживании. С целочисленными входами есть только в виде макросов, от пользователей. Что будут регулировать ваши блоки?