Цифровой фильтр там уже стоит, он встроен в АЦП. В РЭ он описан как фильтр Sinc3-типа. Но пользователю он недоступен. Не думаю, что среднестатистический пользователь сможет правильно рассчитать его коэффициенты.
А скользящее среднее действительно вводит запаздывание, вы правы. На половину длины фильтра (параметр MAv.L разделить пополам и умножить на период выбранной частоты дискретизации АЦП (1/Fдискр.) ).
Если величина запаздывания критична, установите единичную длину фильтра скользящего среднего, это равносильно его отключению.
И вообще, чем больше у прибора настраиваемых параметров, тем больше проблем потом у него. Неразумно давать пользователю измерительную лабораторию. По-моему скромному мнению, правильнее всего было бы предлагать пользователю готовые конфигурации настроек прибора: быстродействующую, медленную высокоточную и т.д. В подавляющем большинстве случаев этого было бы достаточно...