Вы работаете с библиотекой SysFile или CAA File?
Тестировал библиотеку CAA File на файлах с размерами до 2 Гб которые "жили" на USB-накопителе: как чтение, так и запись работает корректно.
Если пришлете проект в формате projectarchive (можно E-mail: support@owen.ru с пометкой "Для Осинского Алексея, с форума"), я посмотрю, может что-нибудь бросится в глаза.
В проекте оставьте только то, что относится к работе с файлами.