Прежде, чем дальше думать, ответьте мне на один вопрос. Как у Вас вал энкодера соединён с шестернью. Я ж не думаю,что
Вы насадили эту шестерню прямо непосредственно на вал энкодера.
Шестерня соединяется с валом энкодера через промежуточный вал, запрессованный в подшипник и через гибкую муфту.