И в будущем не планируется возможность открытия как документ?
Мы во всех проектах, по согласованию с заказчиками, делаем мнемосхемы основным окном (ИМХО - иначе они запутаются во множестве окон). А если надо в виде отдельного, то можно и окном объекта воспользоваться.
Для каждого окна экземпляров нужна переменная. Эти переменные имеют индикацию на главной мнемосхеме.