Есть старое описание при переходе с 1.31, выкладываю. Описанное там актуально и для свежих версий.
Замена прошивки ПЛК.zip
Что касается ошибки, пробуйте таргет 2.0 (тот, который шел с прошивкой 2-01-8). Вполне вероятно, что это и есть "правильный" для вас таргет. только предварительно, для чистоты эксперимента, удалите все установленные таргеты с помощью installTarget, и еще удалите содержимое папки Codesys в корне того логического диска, на котором у вас стоит codesys





