Бывает и такое, что изменения вносятся не только в прошивку контроллера, но и в таргет. Если для новой прошивки нужен будет новый таргет, то в этом случае при копировании проекта, написанного под старый таргет, со старого контроллера гарантий корректной работы на новом контроллере не будет.