Готовой библиотеки под V3 именно для конфигурирования модулей нет, но, как Вы верно заметили, есть для опроса модулей. Как часто Вы планируете конфигурировать модули с СПК, например? Действительно ли есть в этом потребность? Все-таки ПК+преобразователь+конфигуратор все же быстрее и проще. Если можно- опишите более подробно задачу.