При диагностике на компьютере состояния прерывания связи - прервите цикл опроса, закройте порт, и снова начните (открыть порт и начать опрашивать).
Если при этом связь восстановится - ошибка в программе компьютера, где-то большой таймаут ожидания потерянного байта или всей посылки.