У вас одна версия кодесиса стоит, или есть версии ниже? Иногда в такой конфигурации бывает, что при кликаньи по файлу запускается не та версия кодесиса. У меня щас такая проблема постоянно. Поэтому сначала приходится запускать среду, а из неё проект. Но на ваш случай вроде не похожа.