Так в том и суть проблемы. Проект сохраняется, компилируется, загружается, работает в онлайн. Все класс.
Файл -> Закрыть проект. Далее Выход закрываем среду. При этом есть увереность, что все работает. Выключаем комп. Включаем комп. Загружаем CoDeSys. Открыть проект -> вывод окна с ошибкой