Тогда нужно предусмотреть возможность сохранить энергонезависимые переменные в скаде, а после перезаливки программы сохранить их из скады в ПР. Иными словами, сделать бекап. И делать это можно с помощью тех приёмов, о которых говорят Сергей, Мелкий и Алексеев. Но, конечно, потребуется написать саму программу (или макрос) резервного копирования.