Если Вы хотите в режиме эмуляции подать сигнал на первый вход и при этом хотите увидеть сигнал на конфигурационном триггере, настроенном на этот первый вход, то, как правильно сказал Дмитрий Артюховский, в режиме эмуляции этот триггер не будет работать.