Если на одном порту, то либо modbus.lib либо конфигуратор. Чтобы на одном порту мог работать и конфигуратор и еще что-то свое вроде была библиотека unm.lib.
А так либо вешай на разные порты то что опрашивается через конфигуратор и modbus.lib либо опрашивай все через Modbus.lib но уже на одном порту.
ps modbus.lib работает надежнее конфигуратора.