То есть вы на оба компьютера установили одинаковый проект в MasterSCADA Projects\Projects? Вы не грузите один и тот же из расшаренной папки?
Посмотрите статью в блоге:
http://blog.insat.ru/2013/12/blog-post.html
и нашу документацию:
http://www.masterscada.ru/services/s...asterSCADA.pdf
Убедитесь что вы все настроили верно.