Добрый день.
По большинству пунктов очевидно, что процесс перепрошивки был проведен некорректно.
Пользовательская файловая система смонтировалась как временная (tmpfs) - вот после перезагрузки всё и "слетает".

Предоставьте, пожалуйста, завтра утром удаленный доступ по TeamViewer - прошьем контроллер корректно и разберемся с остальными вопросами.