1) Если настраивать как устройство Modbus_COM, то:
COM-порт: 2
Скорость передачи: 9600
Четность: NONE
Информационные биты: 8
Стоповые биты: 2
Таймаут отклика: 1000
Время между фреймами: 50
"галочка" авто перезапуск соединения

Если через ФБ ComConn, то:
Enable: TRUE
PortNum: 2
PortBaudrate: 9600
PortParity: 0
PortStopBits: 3
PortByteSize: 8
Port_ModeOn: FALSE
Port_CloseOn: FALSE

Ставил или так, или так, то есть либо активен был ФБ и я отключал устройство Modbus Master, либо наоборот.

2)Насчет модулей не могу на данный момент сказать, они находятся удаленно (на крыше), завтра смогу их сконфигурировать только и посмотреть.

3)Нет, не сталкивался еще с подобными задачами. Под рукой есть переходник китайский RS485 на CH340. Типа такого http://www.5v.ru/usb-rs485-m1.htm. Он подойдет в качестве тестера? И какие программы для этого предназначены?