К сожалению, автонастройка не панацея, и не всегда может давать абсолютно верные значения для регулятора! Попробуйте перечитать ПИД-коэфициенты вручную.
Так же вопрос по тому, на какой температуре была проведена автонастройка, если равной уставке, тогда нужно действительно, самим пересчитать параметры вручную, если на любой другой температуре, отличной от уставки, то попробовать выставить в параметрах автонастройки температуру равной утавки и провести АНР заново.