обычно пишу условия пуска и стоп отдельным блоком, котрорый обрабатывается в каждом цикле.

как советуют выше.
обязательно заводите сигнал от кнопки на плк как нормально замкнутый, чтобы при обрыве цепи, устройство остановилось.