И так, приоритет имеет файл, но в МОЁМ примере, которым Вы пользуйтесь файла НЕТ.
Расскажу О файлах, добавил в FAQ по модему:
Данные файлы должны быть в ПЛК, только в случае использования модема для связи со средой программирования CoDeSys, например для удаленной загрузки программы (см. инструкцию- http://www.owen.ru/catalog/29188586 ). Файл «CoDeSys.cfg» задаёт порт подключения модема и режим его работы, а так же переводит порт на протокол CoDeSys –Gateway. Файл «modem.cfg» задаёт параметры опроса модема контроллером.
Подробное описание файлов приведено на диске ПЛК в разделе Документация, а так же в соответствующих инструкциях.
Для любого другого обмена по последовательному порту с настройками через «Конфигурацию_ПЛК» или библиотеки – файлов «modem.cfg» и «CoDeSys.cfg» в ПЛК быть не должно, иначе возможны конфликты при обмене.

p.s. Вернемся к вашему проекту.. В чем конкретно проблема?