Прозвонил элементы (резисторы, диоды, транзисторы) входной группы, на первый взгляд всё нормально. Конденсаторы не коротят.
Может это какая то проблема с внутренней прошивкой микроконтроллера раз не даёт калибровать и входное напряжение как надо не обрабатывает?