Вот Евгений удалил мой комментарий.

У меня так было, пока я эту флэшку в запущенный контроллер не вставил, а потом не выдернул. Только после этого контроллер её увидел при включении с зажатой сервисной кнопкой. Не знаю почему, но потом с этой флэшки всё нормально обновлялось. Возможно поможет...