Решено.
Что-то было не так с проектом. Чтобы это выяснить создаём новый проект, символьную конфигурацию и одну переменную в нём и подключаем всё к Owencloud. Если заработало значит дело в проекте.
Сделал следующее:
1)Создал новый проект.
2)В старом выполнил команду Проект - Экспорт
3)В новом соответственно Проект - Импорт
4)Импортировал свои POU, визуализации, переменные, rs485, Ethernet. (В общем всё что изменял при написании программы)
5)Загрузил в СПК и всё заработало.