Так и режим работы MANUAL=true, т.е. не вычисления, а трансляция входа Y_MANUAL на выход Y.

И обнаружил при попытке проверки исполнительных механизмов ещё до настройки ПИД регуляторов, т.е. Ти ещё оставалось равной 0.

В документации не отражено такое поведение, нет указаний на Ти>0. Что остановит киповца при донастройке уменьшить до 0 этот параметр? Сейчас в программе приму меры по ограничению диапазона. Но сколько можно узнавать экспериментально?!