Добрый день.

Скорее всего - при загрузке измененного проекта, созданного в более новой версии CODESYS, повредились файлы тревог.

1. Выполните команду Онлайн - Сброс заводской.
2. Убедитесь, что файлы тревог (/PlcLogic/alarms) были удалены из контроллера.
3. Загрузите проект заново.