1. Совершенно верно - не та версия Target файла. Мы в примерах требуемую версию старались писать. Архив лежит на наем сайте в разделе ПО\CoDeSys\...
2. Это не только не "не правильно" а наоборот правильно разнести модули ВВ и панель на разные интерфейсы. Причем панель рекомендую мастером.
Цикл действительно может несколько увеличится, но насколько для Вас критичен цикл в 1 мс или скажем в 50мс??? Хотя до 50 он по любому не увеличится...
3. эмулировать работу панели в CoDeSys не представляется возможным в принципе. Возможно создать визуализацию, и в ней отрабатывать взаимодействие.