Можно и потом.
Заходите в ресурсы, выбираете Target settings, выбираете нужный файл, нажимаете Ок.
Заходите в PLC Config и делает extras - standart configuration. Эффект будет тот же.
Но лучше сначала, так как сразу можно входам выходам имена присвоить , хотя это с точки зрения культуры программирования и переносимости проекта не совсем правильно