В конфигураторе можно увидеть или сбросить только значение счетчиков на каждом входе. Это аналог команды r.Cou. Она у меня тоже работает.

В итоге разобрался.
Оказывается по запросу r.Cn в базовый адрес прибора выдается битовая маска, содержащая состояния всех входов. Т.е. если замкнут только первый вход, то ответ будет 1. Если второй - то 2, если третий - то 4, если первый и третий - то 5 (1+4) и т.д.

Огромное спасибо за помощь!