Если остановить симуляцию не удается, то выход убить процесс лоджика. Проект до включения режима симуляции был сохранен? Если да, то вышлите мне я посмотрю (можете в личку).
в том-то и дело проект не был сохранен, пришлось убить процесс и начинать заново, так-что обратите внимание на данный баг (невозможность закрыть ошибку)