В алгоритме работы контроллера прописаны подтверждающие сигналы (датчики) от вентиляционной системы, после которых контроллер дает сигналы на управление. Если сигналы не приходят, то контроллер считает что система в аварийном состоянии или близка к аварийной, поэтому он не запускается. Можно конечно попробовать самостоятельно симитировать сигналы, но не рекомендуется, так как для имитации сигналов нужна еще временная задежка.

Также надо понимать насколько быстро меняется температура в выходном канале?
Управление двигателем вентилятора осуществляется через контактор или частотный преобразователь или что-то другое?