Выполняю без команды удаления файла. Но тут проблема похоже в самой программе, т.к. через интерфейс при подключении он такую же ошибку вываливает, но после нажатия "ОК", все равно открывает содержимое контроллера. А в консоли после ошибки выполнение прерывается.

Сейчас решил использовать другую прогу PSCP. Качает она без проблем, только удалять файлы с контроллера похоже не умеет.