Понимаю, что некропостинг, но тем не менее, имею сказать:

1) Если подвисает скада - искать причины в проекте, должно помочь в 99% случаев. Касательно самого Trace mode - судя по отзывам многих людей, глюков в ней хватает. При возможности рассмотреть вариант другой скады.
2) Комп, как понимаю, под управлением винды - а это не ОСРВ, поэтому нет гарантии что скада на компе вовремя сделает какие-то операции со счётчиком. Привязывать что-то жёстко ко времени тут нельзя, всегда может проскочить лаг.
3) Да и вообще, что-то подсказывает что постоянно вырубать комп простым размыканием питания - далеко не гуд...