Не запускается «Master SCADA»

[SCADAMaster]

Если удалить, то удалятся ли свои наработки из папки «Library»?

Проекты и наработки хранятся в папке MasterSCADA Projects, при деинсталляции она не удаляется. Поэтому проекты и библиотеки должны сохранится.
А вот если есть свои собственные ФБ или ВФБ, то они могут удалиться. Поэтому dll с ними нужно сохранить, а после переустановки перерегистрировать (через netreg)

Если гарантия закончилась то обновление платное?

Да, нужно будет продлить техническое сопровождение - подробнее вы можете узнать в отделе продаж.