OwenLogic написан на net 4.5, сам не пробовал, но не вижу особой проблемы запустить его в linux.
У меня не получилось. И еще, MPLAB X и разработчик STM32 выпустили хорошие IDE под свои продукты. Очень опытным я себя не считаю, но работать под UBUNTU можно.