Нет, нельзя - как я уже упоминал, потребуется перезагрузка.
Но я бы предположил, что наблюдаемые "тормоза" связаны с некорректной настройкой опроса ПР на порту PLC.

Это легко проверить - отключите порт PLC в настройках проекта и посмотрите, не пропадут ли тормоза.