Почитал документацию, посмотрел пример, но не понял, возможно ли использовать диспетчер для управления модулями используя два слота сети RS485-1 и RS485-2?
Конечно, можно.
Как правильно сказано выше, просто объявите 2 диспетчера. Для каждого порта свой.