1. В конфигураторе CODESYS действительно есть ограничение в 32 слейва на каждого мастера.
2. Вы можете реализовать опрос через библиотеку Modbus Master - в ней подобных ограничений нет.
3. Если есть очень сильная заинтересованность в опросе >32 слэйвов именно через конфигуратор и готовность к экспериментам, то напишите, пожалуйста, на e.kislov@owen.ru