Есть 2 вариант -у вас не используется 7ячеек памяти в каждом ППЗу ,используйте их для ручного управления ,путем смещения адреса ППЗУ ,в зависимости от состояния 3 доп.входов(ручные режимы) .Можно использовать тот же триггер Старт .Если код на ручных режимах ноль ,то при пуске запускается основная циклограмма (как сейчас) ,если код 1...7,то запускается один цикл .То есть нужно менять уставку в счетчике циклов с 9 на 2 (через сел) и добавлять смещение к адресу ППЗУ (через сел) .То есть в ручном режиме запускается только 1 цикл ,в течении заданного времени (2 ППЗУ,там аналогично добавляется то же смещение) и включаются нужные выходы (ППЗУ1)
вот этот вариант