Попробуйте подключиться через Hyperterminal и посмотрите лог загрузки контроллера. если все в нем нормально, то ваши проблемы либо в настройках Codesys, либо в программе, которая может крутиться в контроллере, если ее туда когда-то кто-то записал. если с логом проблемы, то наверное либо перепрошиться, либо обращаться в СЦ.