В смысле какие то колонки выводить, а какие то нет?
Нужно отключать видимость ненужных колонок. В учебных примерах, в проекте "Примеры отчетов", в объекте "Периодические отчёты - Отчёт с формой" есть пример такого отчета.
В нем видимость колонки задается в форме которая появляется перед построением отчета. Можно использовать этот способ - можно задавать видимость колонок перед началом формирования отчетов из мнемосхемы. Но общий принцип остается такой же.