прописать не заново, а в программе присвоить значение реальных входов/выходов в каналы модбас слейва с такими же типами данных, причем делать это надо разумно, по тому что если с мастера модбас будете делать запись, то чтоб контроллер не затирал Ваши изменения, плюс к тому же любой вход контроллера не возможно изменить, только выхода
А далее ищите для линукса или что там у Вас стоит программу клиент модбаса

У КДС свой протокол, его лучше не трогать, лишняя трата времени