Вопрос решился случайно. Контроллер стал очень долго реагировать на нажатие кнопки подключённой ко входу C1. Как оказалось, при программировании входа С2 я внёс изменения в работу входа С1, а вход С2 как работал по-старому так и работал. Меню почему-то выстроено таким образом, что находясь в меню настроек параметров входа С2, одним нажатием кнопки со стрелкой можно запросто попасть в меню параметров С1. Будьте внимательны!