Про исходники...
При открытии исходников в CoDeSys нужно подключиться к ПЛК. Если даты скомпилированных файлов на компьютере и в самом ПЛК совпадут - CoDeSys просто подключится, а если не совпадут - выдаст сообщение о разных файлах на компьютере и в ПЛК, даже если проект не изменялся, а просто компилировался повторно.
Берите резервный ПЛК и изучайте эти тонкости, все детали не пересказать.