Не хочу показаться некропостером, но проблему Codesys + wine под убунтой заборол. Может, кому будет полезно - ставим кодесис под вайном, не обращаем внимания на сообщения об ошибках. Таргеты проставились без проблем через автоинсталлятор. Далее делаем следующее:

Код:
sudo setcap cap_net_raw+eip /usr/bin/wine
sudo setcap cap_net_raw+eip /usr/bin/wine-preloader
И запускаем кодесис. Связь с ПЛК через Ethernet установилась без всяких плясок с бубном.