Попробовал. Выходит проблема не в скада, а в управлении входами контроллера. При изменении в скада у переменной данных входа с выкл на вкл, изменяются данные выхода с выкл на вкл и, соответствующая переменная в контроллере, тоже изменяется с выкл на вкл (это видно на одновременно подключенной к контроллеру codesys).
Теперь разбираюсь с управлением входами контроллера, т.к. они не управляются даже через "родную" визуализацию codesys.
Если не будет дополнений, тему можно закрыть.