Целевую платформу сменить можно в любом случае в любое время.
Для этого действительно нужно установить Target соответствующий, причем соответствующим образом - например не из архива.

Далее надо перейти на вкладку настройки целевой платформы и в верхнем окошке выбрать нужный контроллер. Нажать ок.

Далее перейти в Конфигурацию ПЛК и из меню "дополнительно" (Extras) выполнить команду стандартная конфигурация. И наслаждаться. Вообще то это описано в документе