1. Несомненно, в ПЛК можно сохранить сорцы и скачивать их утилитой PLCIO перед запуском HMI
2. Это параметр для target-визуализации, Вас не интересует
3. Да, файл RETAIN.DAT - можно его считать с контроллера и потом записать в другой с абсолютно идентичной программой. И перегрузить его кнопкой Reset!