А при чем здесь таймер сторож и программные таймера в проекте???
Программных таймеров TP можно ставить ооооочень много. Они никак не влияют на работу WatchDog.
Если у Вас программа состоит из конкретных шагов - возможно стоит воспользоваться языком SFC