Все энкодеры с выходом line driver -> с контроллером Овен работать не должны, т.к. его входы не предназначены для работы с таким типом сигнала. А на другом контролллере есть входы под сигнал line driver. Меняйте на энкодеры с обычным 24 В транзисторным выходом.